成无己虽然在药效解释方面取得了重要进展，但其说毕竟散在于《伤寒论》的注释中，并没有专门归纳成篇。金·刘完素则不然，他对中药药理进行了初步的归纳。刘氏的《素问药注》今已不存，但其《素问病机气宜保命集·本草论》(1186)中可以充分表达他的药理观。刘氏《本草论》与成无己《伤寒明理论》一样，都是将《素问》中的相关理论用来阐释药理，其中最突出的是药物气味厚薄补泻说的推衍。《神农本草经》中的四气五味，在药物达到上千种的宋、金之时，已经满足不了解释药效之需。因此《素问·阴阳应象大论》的气味厚薄阴阳论，就被引用到药理解释中来。例如刘完素说：“附子、干姜，味甘温大热，味纯阳之药，为气厚者也；丁香、木香，味辛温平薄，为阳之阴气不纯者也。故气所厚则发热，气所薄则发泄。”图2-2《素问病机气宜保命集·药论》示意图〔金〕刘完素，《素问病机气宜保命集·本草论》，见《金元四大家名著集成》（北京：中国中医药出版社，1995），页117。另李时珍《本草纲目》谓此书乃张元素撰，后人误作刘完素撰。但从该书药论内容考辨，与张元素之作并不一样，故不取李说。也就是说，过去的药物性味，又增加了厚（浓烈）薄（淡薄）、阴（寒凉、酸苦咸为阴）阳（温热、辛甘淡为阳）的区分，多了一个层次。
除此以外，刘完素还在《素问病机气宜保命集·药论》中绘制了药理辨析原则的示意图〔金〕刘完素，《素问病机气宜保命集·药论》，明《医统正脉全书》刻本，卷下，页48。。该图把药物的“性味”和“法象”糅合在一起，主干为“形、色、性、味、体”药理五要素。然后右侧支又再细分五形（金木水火土）、五色（青赤黄白黑）、五性（寒热温凉平）、五味（辛酸咸苦甘）、五体（虚实轻重中）；左侧支则将五要素又一分为二：形分真假、色分深浅、性分急缓、味分厚薄、体分润枯。这实际上是将药理五要素用阴阳、五行又再细划分。如此体系，自然比早期简单的四气五味要丰富得多，也比《圣济经·药理篇》要实用得多。因此，刘完素可以说是金元药理体系化的带头者。
金元药理体系构建中最富有成效的是易水学派领军人物张元素及其弟子李东垣。张元素在《珍珠囊》中提出的药理体系〔金〕张元素，《珍珠囊》，见《医药集览》（明刊经厂黑口本），插页。，有很多新的总结，分出了更多的层次。他把用药与时、卦、季节等联系在一起，用一个图构成了他独特的药理模式。其中最突出的进展有如下几个方面：
图2-3《珍珠囊》药象图 |
