朱元璋最重视兵权。绝不把兵权轻易属人。在他未即位之初，多用养子为心腹，凡克城池，都令其与将官同守 ，用以进行钳制。朱元璋夺取集庆后，设立了大都督府，作为最高的军事统帅机关，他将大都督这一重要职务交给了皇侄朱文正 ，等到朱元璋有了亲生的儿子，他便逐步放心地把兵权交给他们掌握。他先是设立护军府，后又于洪武五年设置了亲王护卫指挥使司 ，规定每王府三护卫，每卫设左右前后中五所，所千户二人，百户十人，此外，还有两个围子手所。所千户一人。因此在一般情况下，每个亲王都拥有大约一千五百人的兵力。
但是，屡经修改的《皇明祖训》又规定：“王府指挥司官并属官随军多少设置，不拘数目。” 实际等于说王府所统帅的军队没有限制。而事实上，在洪武时期也确实如此。《皇明祖训》里还规定：“凡王教练军士，一月十次，或七八次，五六次。若临时有警，或王有闲暇，则遍数不拘”。 这就给亲王更多的接近军队、熟悉战阵的机会。
朱棣在诸王中自幼便以悍勇著称。年龄稍长，更显出其所怀心志与诸王不同，尤其好游侠，善于骑射 。这次到中都拜谒乡里的另一个重要目的是讲习武事，这使朱棣有如鱼儿得水，格外遂心。凤阳是他试飞的起点，这里的生活使他终生难忘 。
这次燕王他们去凤阳足有半年多。九月初七日，他们一行奉命回到京师。
洪武十一年初，朱元璋决定让秦王、晋王前往自己的封国。五月初四，秦晋王临行，朱元璋分别赐给他们以玺书，再做一次叮嘱。给秦王的玺书写道：
关内之民，自元氏失政以来，不胜其弊。及吾平定天下，又有转输之劳。西至于凉州，北至于宁夏，南至于河州，民未休息，予甚悯焉。今尔之国，若宫室已完，其余不急之役，宜悉缓之，勿重劳民也。
给晋王的玺书写道：
大原之民困於元氏弊政久矣。又尝出力悦馕以供我师。勤劳憔悴，吾未尝不于怜之。尔㭎之国，务爱养生息，勿复以不急之役扰之，其体吾意。
这两道玺书，不过讲了些要体恤民情、爱惜民力的话。其实，在朱元璋看来，西安、太原两地十分重要，不仅这里与故元势力近在咫尺，而且，朱元璋认为这里是天下形势所在，特别是西安作为历代的都城，朱元璋一直有意迁都于此。所以他对秦晋二王实在是深有寄重。大概那些寄重的话早已说过至此已无须重复了吧！不过，真令人怀疑，这两段话中是否有什么材料故意被人删除而隐瞒了 。
就在命令秦王、晋王就藩的同时，朱元璋命令燕王、周王、楚王、齐王再次还驻凤阳。这次到凤阳去，距上次回还恰恰是一年半整。秦晋二王就藩之后，在凤阳的诸王就以燕王为最年长了。朱元璋又教训他们说：
昔有道之君，皆身勤政事，心存生民，所以能保守天下。至其子孙，废业厥德，色荒于内，禽荒于外，政教不修，礼乐崩弛，则天弃於上，民离于下，遂失其天下国家，为吾子孙者，当取法於古之圣帝哲王，兢兢业业，日慎一日，鉴彼荒淫，勿蹈其辙，则可以长享富贵矣。
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