侵略军又调动一艘最大的军舰“赫克托”号，张牙舞爪地开了过来，阻止郑军的船只继续登岸。郑成功沉着镇定，指挥他的60艘战船把“赫克托”号围住。郑军的战船小，行动灵活。郑成功号令一下，60多只战船一齐发炮，“赫克托”号中弹起火。大火熊熊燃烧，把海面照得通红。“赫克托”号渐渐沉没下去，还有3艘荷兰船一看形势不妙，吓得掉头就逃。
荷兰侵略军遭到惨败，赤嵌的敌军便躲进城内，闭而不战。这样，郑成功的军队就把整个城围得水泄不通。荷兰人见此状觉不是长久之计，于是他们一面偷偷派人到巴达维亚（今爪哇）去搬救兵，一面派使者到郑军大营求和，并宁愿献上十万两白银慰劳将士。
荷兰人很快收到郑成功的回信：“然台湾者，中国之土地，久为贵国所据，今吾既来索还，该土地自当归我。”并且表示，如果愿意投降，则生命财产安全将受到保障；否则，到那时必土崩瓦解、玉石俱焚，悔之晚矣！郑成功的信明确表示，荷兰殖民者只有投降一条路。
5月3日，荷兰使者秘书韦恩·利普伦和检察官伍德·豪斯威尔，来到郑成功大营，提出愿意支付一笔赔款给郑成功，但郑成功必须退出台湾；荷兰人可以退出台湾，但必须继续居住大员。郑成功在领土和主权问题上没有做交易，再次明确坚持要么荷兰人全部撤离台湾，要么武力解决。
荷兰殖民当局见谈判没有成果，被迫于公元1661年5月4日交出已经被围得水泄不通的城池，以保在台湾的最后一个据点——热兰遮城。
长远打算 屯垦开发
收复赤嵌城后，郑成功的大军开进大员市区。揆一在决定撤出大员市区的同时，下令上尉哈豪维尔拆除装在市区的4座大炮，把市区的所有荷兰人迁往热兰遮城中，同时烧毁工厂、作坊、货栈、粮仓，给中国军队留下一座废墟。殖民者还在进行着最后的狗延残喘。
面对殖民者的暴行，郑成功率军突袭哈豪维尔的营地，断荷兰人的退路。荷兰方面在中国军队的进攻之下，数百名荷军和奴仆被杀被伤，哈豪维尔带着残余军队，杀开一条血路逃入热兰遮城，放火焚城计划失败，郑军在民众的欢迎之中，进入大员城。
台湾作战胜利之时，也迎来了从厦门赶来的后续部队，两军会师，郑军信心大增，民众欢欣鼓舞。
胜利在望的郑成功开始实施长期固守计划，在占领区设立行政管理系统。最高行政机构为承天府，后改为台湾府，府治设在赤嵌楼；分为东安、西安、宋南、镇北四坊；由杨朝栋为承天府府尹。北路天兴县，南至新港溪，北至鸡笼，县治设在大目降和新港之间（今新市乡），由庄文烈为知县。南路为万年县，县治设于二赞行（今台南县仁德乡二行村），由祝敬任知县。这是中国人在岛上设立的第一套行政管理机构。
同时，郑成功出于长远考虑，同时出于解决粮草供应和长期包围热兰遮城、把台湾建成军事基地的需要，决定实施“寓兵于农计划”。除了包围热兰遮城的部队外，其余军队奔赴大员南北进行屯垦；同时，也从闽粤沿海地区招募移民，开发土地。郑成功的军事屯垦和移民政策，形成新一波的开发热潮。 |
