从1992年至1996年的4年间，普京担任圣彼得堡的副市长和第一副市长，成为这个大城市的主要官员。
索布恰克将管理经济的大权交给了年轻的副市长，而普京也忠心耿耿地为索布恰克服务。普京在圣彼得堡市政府可以说大权在握，言出必行，一时成了圣彼得堡市炙手可热的人物。
俄罗斯在叶利钦的“休克疗法”和私有化之后，原来的计划经济体制基本被破除了，但是经济的发展仍未走上一条稳定持续发展的道路。圣彼得堡在这几年里，市场经济有了一定的发展，特别是外资的引进在俄罗斯居前列。
丘拜斯在领导实施私有化时，多次和负责圣彼得堡经济的普京打交道。丘拜斯后来回忆说，普京虽然不是学经济的，但是对复杂的经济问题领悟得很快。
普京分管的范围包括强力机构（警察、安全、司法、海关、边防等部门）和社会团体、旅馆、赌场和外国机构的办事处以及大型投资项目的审批。这些事务比较繁琐，但是接触面广，普京通常都代表索布恰克参加谈判并在向索布恰克请示后作出决定。
索布恰克非常信任普京，凡是普京决定的事项，索布恰克都会批准。
圣彼得堡工商界乃至于黑社会的人士因此都知道，有事必须找普京。外商更是将结识普京作为进入圣彼得堡的必要条件。因此，人们称普京为“斯摩尔尼宫的灰衣主教”。
普京在圣彼得堡工作的6年非常重要，甚至可以说影响着普京今后的人生。并且这对普京后来到莫斯科工作，都是很有益的。任何政治首先都是地方的政治，有没有在一个城市或一个地区担任行政首长的经历，当然差别很大。他过去一直服役于克格勃，从来没有做过行政方面的工作，没有管理经济的经验。从德国回国后，普京在圣彼得堡经历了苏联解体、苏共解散、1991年和1993年事件这些惊心动魄的变局，经历并且参与了由苏联的集权政治和计划经济体制向民主政治和市场经济的转变，又领导了圣彼得堡的市政府，从而积累了可贵的政治、行政和管理经验，包括和媒体打交道的经验，为其今后领导俄罗斯打下了坚实的基础。
1996年5月，索布恰克竞选连任失败。新市长雅科夫列夫邀请普京留任，但是普京认为这是对恩师的背叛，所以谢绝了他的提议。
落魄的索布恰克尝尽世态炎凉，旅居巴黎养病，昔日的朋友大多疏远了，只有普京还和他保持着联系。普京本人的地位后来逐渐上升，在可能的情况下，一直为避居巴黎的索布恰克提供力所能及的帮助。对此索布恰克是心怀感激的，他说：“我在被迫出走法国后，曾给我认为是朋友的许多人打过电话，但他们都不再理睬我。而普京却总是能接听我的电话，并给我以力所能及的帮助……” |
